Problema 1

Problema 1: processamento de resultados de RNA-seq

Objetivos

1. Normalizar os dados de expressão gênica para que sejam comparáveis.

• Comprimento dos transcritos

2. Verificar se o "n amostral" apresentado é suficiente para análise de expressão diferencial.

3. Identificar os genes diferencialmente expressos.

4. Visualização de dados de expressão.

Desenvolvimento de código

Códigos deverão usar as seguintes bibliotecas de python 3:

1. matplotlib
2. pandas

Referências

Ching, Travers, Sijia Huang, and Lana X. Garmire. "Power analysis and sample size estimation for RNA-Seq differential expression." Rna 20.11 (2014): 1684-1696.