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377
<!DOCTYPE html>
<html>
<head>
<title>Bases de données Dynafor</title>
<meta charset="utf-8">
<meta name="description" content="Bases de données Dynafor">
<meta name="author" content="Wilfried Heintz">
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<slides class="layout-widescreen">
<!-- LOGO SLIDE -->
<slide class="title-slide segue nobackground">
<aside class="gdbar">
<img src="assets/img/Dynafor.jpg">
</aside>
<hgroup class="auto-fadein">
<h1>Bases de données Dynafor</h1>
<h2>Point sur l'intégration des données</h2>
<p>Wilfried Heintz<br/>UMR 1201 Dynafor, INRA, Toulouse</p>
</hgroup>
<article></article>
<footer class = 'license'>
<a href='http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/'>
<img width = '80px' src = 'http://mirrors.creativecommons.org/presskit/buttons/88x31/png/by-nc-sa.png'>
</a>
</footer>
</slide>
<!-- SLIDES -->
<slide class="" id="slide-1" style="background:;">
<hgroup>
<h2>Un serveur dédié</h2>
</hgroup>
<article data-timings="">
<p><img style="position: absolute; top: 0; right: 10px; border: 0; width:450px;" src="assets/img/postgresql.png"></p>
<h3>Pour des BDD partagées et pérennes</h3>
<ul>
<li>Machine virtuelle hébergée et <b><u>sauvegardée</u></b> sur le datacenter</li>
<li>Logiciel PostgreSQL</li>
<li>Accessible à tous : 147.100.166.41</li>
<li class='..'>Moyennant une authentification.</li>
</ul>
</article>
<!-- Presenter Notes -->
</slide>
<slide class="" id="slide-2" style="background:;">
<hgroup>
<h2>Des outils pour consulter</h2>
</hgroup>
<article data-timings="">
<p><img style="position: absolute; top: 10px; right: 10px; border: 0; width:211px;" src="assets/img/phppgadmin.gif"></p>
<h3>Phppgadmin</h3>
<ul>
<li>Accessible en ligne depuis partout</li>
<li>Via un navigateur Web</li>
<li><p><a href="http://dynafor.toulouse.inra.fr/phppgadmin">http://dynafor.toulouse.inra.fr/phppgadmin</a></p></li>
<li><p>Ergonomie limitée ...</p></li>
</ul>
</article>
<!-- Presenter Notes -->
</slide>
<slide class="" id="slide-3" style="background:;">
<hgroup>
<h2>Des outils pour consulter</h2>
</hgroup>
<article data-timings="">
<p><img style="position: absolute; top: 5px; right: 20px; border: 0; width:349px;" src="assets/img/PgAdmin.jpg"></p>
<h3>PgAdmin4</h3>
<ul>
<li>Client monoposte à installer</li>
<li><p>Procédure d'authentification moins "immédiate"</p></li>
<li><p>Ergonomie et fonctionnalités améliorées</p></li>
</ul>
</article>
<!-- Presenter Notes -->
</slide>
<slide class="" id="slide-4" style="background:;">
<hgroup>
<h2>Solutions pour déposer des données</h2>
</hgroup>
<article data-timings="">
<h3>Manuellement</h3>
<ul>
<li>Avec phppgamdin ou en ligne de commande</li>
<li>Tableau CSV -> table de base de données</li>
<li>! Respect de la structure de la table !</li>
</ul>
<h3>Automatiquement</h3>
<ul>
<li>Nano-ordinateurs : BDD embarquée</li>
<li>A ce propos : Journée RBDD "Cahiers de Terrain électroniques"
<a href="http://rbdd.cnrs.fr/spip.php?article206">http://rbdd.cnrs.fr/spip.php?article206</a> </li>
<li>Projet Pi4x4</li>
</ul>
</article>
<!-- Presenter Notes -->
</slide>
<slide class="" id="slide-5" style="background:;">
<hgroup>
<h2>Solutions pour déposer des données géographiques</h2>
</hgroup>
<article data-timings="">
<h3>Manuellement</h3>
<ul>
<li><p>shp2pgsql <br/>
<span style="font-size:20px;"><code>shp2pgsql -s SRID myshapefile.shp myschema.mytable > myfile.sql</code></span></p></li>
<li><p>ogr2ogr <br/>
<span style="font-size:20px;"><code>ogr2ogr -f 'PostgreSQL' PG:'host=myhost user=myloginname dbname=mydbname password=mypassword' myshapefile.shp</code></span></p></li>
</ul>
<h3>Avec assistant</h3>
<ul>
<li>QGIS + DBManager</li>
</ul>
</article>
<!-- Presenter Notes -->
</slide>
<slide class="" id="slide-6" style="background:;">
<hgroup>
<h2>Des outils pour manipuler</h2>
</hgroup>
<article data-timings="">
<p><img style="position: absolute; top: 10px; right: 20px; border: 0; width:274px;" src="assets/img/qgis.png"></p>
<h3>QGIS</h3>
<ul>
<li>Logiciel SIG libre et gratuit :-D</li>
<li><p>Peut se connecter à une base pour afficher/éditer des données géographiques</p></li>
<li><p>Ergonomie et fonctionnalités améliorées</p></li>
</ul>
</article>
<!-- Presenter Notes -->
</slide>
<slide class="" id="slide-7" style="background:;">
<hgroup>
<h2>Des outils pour manipuler</h2>
</hgroup>
<article data-timings="">
<p><img style="position: absolute; top: 10px; right: 20px; border: 0; width:400px;" src="assets/img/arcgis.gif"></p>
<h3>ArcGIS</h3>
<ul>
<li>Logiciel SIG propriétaire et payant :-(</li>
<li>Mais très utilisé et dispose d'un SAV !</li>
<li><p>Peut se connecter à une base pour afficher/éditer des données géographiques</p></li>
<li><p>Nécessite l'extension <b>PostgreSQL Client Libraries</b></p></li>
</ul>
</article>
<!-- Presenter Notes -->
</slide>
<slide class="" id="slide-8" style="background:;">
<hgroup>
<h2>Des outils pour manipuler</h2>
</hgroup>
<article data-timings="">
<p><img style="position: absolute; top: 10px; right: 10px; border: 0; width:145px;" src="assets/img/r.jpg"></p>
<h3>R</h3>
<ul>
<li>Logiciel libre et gratuit :-)</li>
<li>Peut se connecter à une base pour générer un dataframe</li>
<li>via un package (RPostgreSQL)</li>
</ul>
</article>
<!-- Presenter Notes -->
</slide>
<slide class="" id="slide-9" style="background:;">
<hgroup>
<h2>Quelques chiffres</h2>
</hgroup>
<article data-timings="">
<p><img style="position: absolute; top: 10px; right: 10px; border: 0; width:145px;" src="assets/img/Dynafor.jpg"></p>
<h3>Bases de données de projet</h3>
<ul>
<li>13 dont 12 spatiales</li>
<li>4 interfacées</li>
<li>2 diffusées sur Internet</li>
<li><p>2 éditées "en direct" par des agents Dynafor</p>
<p><b>=> N'hésitez plus à convertir vos données !</b></p></li>
</ul>
</article>
<!-- Presenter Notes -->
</slide>
<slide class="" id="slide-10" style="background:;">
<hgroup>
<h2>Focus sur EasyTrems</h2>
</hgroup>
<article data-timings="">
<p><img style="position: absolute; top: 10px; right: 10px; border: 0; width:280px;" src="assets/img/easytrems.png"></p>
<h3>Bases de données dendromicrohabitats</h3>
<ul>
<li>7 niveaux hiérarchiques imbriqués</li>
<li>1 table relevés</li>
<li><p>4 tables référentielles (arbre,manip,espèce,genre)</p></li>
<li><p>Interface Internet + Pi</p></li>
</ul>
</article>
<!-- Presenter Notes -->
</slide>
<slide class="" id="slide-11" style="background:;">
<hgroup>
<h2>Focus sur EasyTrems</h2>
</hgroup>
<article data-timings="">
<p><img style="position: absolute; top: 130px; right: 60px; border: 0; width:900px;" src="assets/img/mcd_easytrems.png"></p>
</article>
<!-- Presenter Notes -->
</slide>
<slide class="backdrop"></slide>
</slides>
<div class="pagination pagination-small" id='io2012-ptoc' style="display:none;">
<ul>
<li>
<a href="#" target="_self" rel='tooltip'
data-slide=1 title='Un serveur dédié'>
1
</a>
</li>
<li>
<a href="#" target="_self" rel='tooltip'
data-slide=2 title='Des outils pour consulter'>
2
</a>
</li>
<li>
<a href="#" target="_self" rel='tooltip'
data-slide=3 title='Des outils pour consulter'>
3
</a>
</li>
<li>
<a href="#" target="_self" rel='tooltip'
data-slide=4 title='Solutions pour déposer des données'>
4
</a>
</li>
<li>
<a href="#" target="_self" rel='tooltip'
data-slide=5 title='Solutions pour déposer des données géographiques'>
5
</a>
</li>
<li>
<a href="#" target="_self" rel='tooltip'
data-slide=6 title='Des outils pour manipuler'>
6
</a>
</li>
<li>
<a href="#" target="_self" rel='tooltip'
data-slide=7 title='Des outils pour manipuler'>
7
</a>
</li>
<li>
<a href="#" target="_self" rel='tooltip'
data-slide=8 title='Des outils pour manipuler'>
8
</a>
</li>
<li>
<a href="#" target="_self" rel='tooltip'
data-slide=9 title='Quelques chiffres'>
9
</a>
</li>
<li>
<a href="#" target="_self" rel='tooltip'
data-slide=10 title='Focus sur EasyTrems'>
10
</a>
</li>
<li>
<a href="#" target="_self" rel='tooltip'
data-slide=11 title='Focus sur EasyTrems'>
11
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</li>
</ul>
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