covid19-aichi-tools

愛知県 新型コロナウイルス感染症対策サイト用のデータ更新用スクリプト

必要なもの

• Python3

準備

リポジトリをクローンする。

$ git clone https://github.com/code4nagoya/covid19-aichi-tools.git
$ cd covid19-aichi-tools

下記の3ファイルを更新する。

• data/patients.csv
• data/main_summary.csv
• data/inspections_summary.csv

Googleドライブで管理している最新データをダウンロードする場合は下記コマンドを実行する。

$ wget "https://docs.google.com/spreadsheets/d/12qStuXjsI8GE8qI1mLPLV--6TQcxAMPDu3-k9RCHN1k/export?format=csv&gid=0" -O data/patients.csv
$ wget "https://docs.google.com/spreadsheets/d/1DdluQBSQSiACG1CaIg4K3K-HVeGGThyecRHSA84lL6I/export?format=csv&gid=0" -O data/main_summary.csv
$ wget "https://docs.google.com/spreadsheets/d/1ivROd_s3AmvY480XKEZR_COAlx08gOGxZYRYubxghP0/export?format=csv&gid=0" -O data/inspections_summary.csv

data/patients.csvのスクレイピングによる生成について(実験段階)

data/patients.csvについては下記コマンドにより、愛知県の公式サイトで公開されているPDFから生成することもできます。

事前準備

ghostscriptが必要です。インストールする場合は例えばUbuntuであれば下記コマンドを実行してインストールしてください。

$ sudo apt-get install ghostscript

また、いくつかのモジュールをpipでインストールする必要があります。

$ sudo pip install -r requirements.txt

スクレイピングの実行

下記コマンドを実行すると、data/patients.csvが生成されます。

python3 scrape_patiants.py

使い方

https://www.pref.aichi.jp/site/covid19-aichi/

愛知県新型コロナウイルス感染症トップページの愛知県の感染症発生状況（画像）に記載のある日付を

YYYY-MM-DD形式で引数に付けてコマンドを実行してください。

3月25日○○時現在であれば

$ python3 build_json.py 2020-03-25 > data/data.json

生成されたdata/data.jsonを、下記リポジトリのdata/data.jsonと差し替える。

https://github.com/code4nagoya/covid19

検査実施件数のみを更新する場合

$ wget "https://docs.google.com/spreadsheets/d/1ivROd_s3AmvY480XKEZR_COAlx08gOGxZYRYubxghP0/export?format=csv&gid=0" -O data/inspections_summary.csv
$ python3 build_inspection_json.py > data/data_inspections.json

生成されたdata/data_inspections.jsonを、下記リポジトリのdata/data_inspections.jsonと差し替える。

https://github.com/code4nagoya/covid19

データの形式について

data/patients.csv

「陽性患者数」や「陽性患者の属性」のグラフに使用するデータです。

出典元: https://www.pref.aichi.jp/site/covid19-aichi/kansensya-kensa.html の県内発生事例一覧(PDFファイル)

• 下記のヘッダ行が必要です。
• ヘッダ行の各カラム名がそのままJSONに出力されます。

ヘッダ	データ	例
No	連番の数値	1
発表日	YYYY/m/d	2020/2/24
年代・性別	文字列	40代男性
国籍	文字列	日本
住居地	文字列	名古屋市
接触状況	文字列	No.4と接触
備考	文字列	本県発表
date	YYYY-MM-DD	2020-02-24
w	曜日を表す数値(0が日曜日)	2
short_date	YY/MM	02¥/24

data/main_summary.csv

「検査陽性者の状況」のグラフに使用するデータです。

出典元: https://www.pref.aichi.jp/site/covid19-aichi/ の検査陽性者の状況

• ヘッダ行は不要です。
• ヘッダ列が必要です。
• 下記の行が必要です。

ヘッダ列(1列目)	データ列(2列目)
検査実施人数	数値
陽性患者数	数値
入院中	数値
軽症・中等症	数値
重症	数値
退院	数値
転院	数値
死亡	数値

data/inspections_summary.csv

「検査実施件数」のグラフに使用するデータです。

出典元: https://www.pref.aichi.jp/site/covid19-aichi/kansensya-kensa.html の新型コロナウイルス遺伝子検査件数

• 下記のヘッダ行が必要です。
• ヘッダ行の各カラム名がそのままJSONに出力されます。

ヘッダ	データ	例
検査日	YYYY/m/d	2020/03/02
検査件数（件）	数値	639
陽性者数（人）	数値	30
備考	文字列	1月30日（木曜日）～3月1日（日曜日）